Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYRIPQ8NFW9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYRIPQ8NFW9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYRIPQ8NFW9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYRIPQ8NFW9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYRIPQ8NFW9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms