Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF397Q8NF99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF397Q8NF99 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF397Q8NF99 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF397Q8NF99 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms