Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC51

SERBP1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1Q8NC51 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 517.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 50.5
SERBP1Q8NC51 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 413.18□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 50.5
SERBP1Q8NC51 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 50.4
SERBP1Q8NC51 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 50.4
SERBP1Q8NC51 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.024e-6■■■■■ 49.9
SERBP1Q8NC51 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 49.9
SERBP1Q8NC51 YIF1B-206ENST00000586319 936 ntTSL 316.87■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 49.9
SERBP1Q8NC51 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 49.9
SERBP1Q8NC51 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 49.9
SERBP1Q8NC51 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 49.9
SERBP1Q8NC51 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 49.8
SERBP1Q8NC51 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 49.8
SERBP1Q8NC51 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 49.8
SERBP1Q8NC51 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 49.5
SERBP1Q8NC51 ATP5D-203ENST00000588538 1393 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 49.5
SERBP1Q8NC51 ATP5D-205ENST00000590265 1144 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 49.5
SERBP1Q8NC51 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 49.5
SERBP1Q8NC51 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 49.5
SERBP1Q8NC51 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 49.2
SERBP1Q8NC51 JUND-202ENST00000600972 500 ntTSL 225.55■■□□□ 1.683e-14■■■■■ 48.7
SERBP1Q8NC51 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 525.26■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 48.3
SERBP1Q8NC51 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 314.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 48.3
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.66e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)29.09■■■□□ 2.256e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.936e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.86e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.766e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.726e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.666e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.656e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.656e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.616e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.546e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)24.14■■□□□ 1.456e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.456e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.436e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CPOX-205ENST00000515041 1030 ntTSL 223.81■■□□□ 1.46e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.396e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.386e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)23.29■■□□□ 1.326e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.286e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.286e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PITX1-206ENST00000507253 587 ntTSL 322.97■■□□□ 1.276e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 322.95■■□□□ 1.266e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.256e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PITX1-202ENST00000502676 666 ntTSL 322.65■■□□□ 1.226e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 522.12■■□□□ 1.136e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 322.05■■□□□ 1.126e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)21.76■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MGAT4B-205ENST00000518778 1568 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.076e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 521.67■■□□□ 1.066e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 FAM50A-203ENST00000464419 1470 ntTSL 521.51■■□□□ 1.036e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MGAT4B-216ENST00000520969 1096 ntTSL 321.47■■□□□ 1.036e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 AKT1-217ENST00000557494 408 ntTSL 221.2■□□□□ 0.986e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.966e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.936e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.926e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.96e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MGAT4B-209ENST00000519836 1686 ntTSL 1 (best)20■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 STRN4-222ENST00000601869 2240 nt19.81■□□□□ 0.766e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.686e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.666e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.656e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.646e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.66e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 SAMD1-203ENST00000541938 143 ntTSL 318.73■□□□□ 0.596e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.56e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.486e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.486e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PLEKHA2-203ENST00000519640 565 ntTSL 517.96■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 217.92■□□□□ 0.466e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.438e-11■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PALM-206ENST00000589012 579 ntTSL 317.62■□□□□ 0.416e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.46e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.386e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.386e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 517.39■□□□□ 0.376e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 517.24■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 FLNA-218ENST00000498491 914 ntTSL 517.18■□□□□ 0.346e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 416.73■□□□□ 0.276e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 NCOR2-219ENST00000474079 321 ntTSL 216.67■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 NCOR2-216ENST00000461081 2910 ntTSL 216.6■□□□□ 0.256e-6■■■■■ 47.7
SERBP1Q8NC51 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.256e-6■■■■■ 47.7
Retrieved 100 of 2,723 protein–RNA pairs in 57 ms