RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567383.5

UBE2I-216, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 I, humanhuman

TSL 4

Gene UBE2I, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2I-216ENST00000567383 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.2■■■■■ 4.35
UBE2I-216ENST00000567383 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.52■■■■□ 3.6
UBE2I-216ENST00000567383 ABCC9O60706 1549 aa36.8■■■■□ 3.48
UBE2I-216ENST00000567383 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.34■■■■□ 3.25
UBE2I-216ENST00000567383 NACADO15069 1562 aa35.29■■■■□ 3.24
UBE2I-216ENST00000567383 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.21■■■■□ 3.23
UBE2I-216ENST00000567383 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
UBE2I-216ENST00000567383 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.07■■■■□ 3.21
UBE2I-216ENST00000567383 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.91■■■■□ 3.18
UBE2I-216ENST00000567383 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.62■■■■□ 3.13
UBE2I-216ENST00000567383 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
UBE2I-216ENST00000567383 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.37■■■■□ 3.09
UBE2I-216ENST00000567383 SCRIBQ14160 1630 aa34.23■■■■□ 3.07
UBE2I-216ENST00000567383 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.96■■■■□ 3.03
UBE2I-216ENST00000567383 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.88■■■■□ 3.01
UBE2I-216ENST00000567383 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
UBE2I-216ENST00000567383 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.3■■■□□ 2.92
UBE2I-216ENST00000567383 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.06■■■□□ 2.88
UBE2I-216ENST00000567383 SMARCA4P51532 1647 aa32.75■■■□□ 2.83
UBE2I-216ENST00000567383 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
UBE2I-216ENST00000567383 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.61■■■□□ 2.81
UBE2I-216ENST00000567383 NCAPD3P42695 1498 aa32.6■■■□□ 2.81
UBE2I-216ENST00000567383 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.54■■■□□ 2.8
UBE2I-216ENST00000567383 SMARCA2P51531 1590 aa32.51■■■□□ 2.79
UBE2I-216ENST00000567383 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.45■■■□□ 2.78
UBE2I-216ENST00000567383 HMGXB3Q12766 1538 aa32.4■■■□□ 2.78
UBE2I-216ENST00000567383 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
UBE2I-216ENST00000567383 WIZO95785 1651 aa32.18■■■□□ 2.74
UBE2I-216ENST00000567383 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
UBE2I-216ENST00000567383 NESP48681 1621 aa31.86■■■□□ 2.69
UBE2I-216ENST00000567383 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
UBE2I-216ENST00000567383 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.72■■■□□ 2.67
UBE2I-216ENST00000567383 ERCC6Q03468 1493 aa31.65■■■□□ 2.66
UBE2I-216ENST00000567383 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.62■■■□□ 2.65
UBE2I-216ENST00000567383 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.48■■■□□ 2.63
UBE2I-216ENST00000567383 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.47■■■□□ 2.63
UBE2I-216ENST00000567383 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.46■■■□□ 2.63
UBE2I-216ENST00000567383 CFTRP13569 1480 aa31.43■■■□□ 2.62
UBE2I-216ENST00000567383 CUX2O14529 1486 aa31.39■■■□□ 2.62
UBE2I-216ENST00000567383 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
UBE2I-216ENST00000567383 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.25■■■□□ 2.59
UBE2I-216ENST00000567383 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
UBE2I-216ENST00000567383 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.2■■■□□ 2.58
UBE2I-216ENST00000567383 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.18■■■□□ 2.58
UBE2I-216ENST00000567383 PRDM2Q13029 1718 aa31.17■■■□□ 2.58
UBE2I-216ENST00000567383 WDR62O43379 1518 aa31.1■■■□□ 2.57
UBE2I-216ENST00000567383 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
UBE2I-216ENST00000567383 TOPBP1Q92547 1522 aa30.76■■■□□ 2.51
UBE2I-216ENST00000567383 ABCC8Q09428 1581 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2I-216ENST00000567383 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.7■■■□□ 2.5
UBE2I-216ENST00000567383 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.58■■■□□ 2.49
UBE2I-216ENST00000567383 IFT140Q96RY7 1462 aa30.56■■■□□ 2.48
UBE2I-216ENST00000567383 CUX1P39880 1505 aa30.52■■■□□ 2.48
UBE2I-216ENST00000567383 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
UBE2I-216ENST00000567383 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
UBE2I-216ENST00000567383 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
UBE2I-216ENST00000567383 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.4■■■□□ 2.46
UBE2I-216ENST00000567383 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.38■■■□□ 2.45
UBE2I-216ENST00000567383 SOGA1O94964 1423 aa30.35■■■□□ 2.45
UBE2I-216ENST00000567383 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.45
UBE2I-216ENST00000567383 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.445e-7■■■□□ 15.4
UBE2I-216ENST00000567383 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
UBE2I-216ENST00000567383 SYNJ1O43426 1573 aa30.23■■■□□ 2.43
UBE2I-216ENST00000567383 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.22■■■□□ 2.43
UBE2I-216ENST00000567383 TOP2BQ02880 1626 aa30.22■■■□□ 2.43
UBE2I-216ENST00000567383 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
UBE2I-216ENST00000567383 WDR97A6NE52 1622 aa30.18■■■□□ 2.42
UBE2I-216ENST00000567383 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.11■■■□□ 2.41
UBE2I-216ENST00000567383 OSCARQ8IYS5 282 aa30.08■■■□□ 2.41
UBE2I-216ENST00000567383 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30■■■□□ 2.39
UBE2I-216ENST00000567383 GRIN2BQ13224 1484 aa29.99■■■□□ 2.39
UBE2I-216ENST00000567383 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.99■■■□□ 2.39
UBE2I-216ENST00000567383 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.98■■■□□ 2.39
UBE2I-216ENST00000567383 CHD1O14646 1710 aa29.97■■■□□ 2.39
UBE2I-216ENST00000567383 PBRM1Q86U86 1689 aa29.95■■■□□ 2.38
UBE2I-216ENST00000567383 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
UBE2I-216ENST00000567383 FBLN2P98095 1184 aa29.87■■■□□ 2.37
UBE2I-216ENST00000567383 SYNJ2O15056 1496 aa29.81■■■□□ 2.36
UBE2I-216ENST00000567383 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
UBE2I-216ENST00000567383 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.73■■■□□ 2.35
UBE2I-216ENST00000567383 ADAMTS12P58397 1594 aa29.71■■■□□ 2.35
UBE2I-216ENST00000567383 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.66■■■□□ 2.34
UBE2I-216ENST00000567383 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
UBE2I-216ENST00000567383 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
UBE2I-216ENST00000567383 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
UBE2I-216ENST00000567383 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.64■■■□□ 2.34
UBE2I-216ENST00000567383 GRIN2AQ12879 1464 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2I-216ENST00000567383 ARHGEF11O15085 1522 aa29.61■■■□□ 2.33
UBE2I-216ENST00000567383 KIF27Q86VH2 1401 aa29.6■■■□□ 2.33
UBE2I-216ENST00000567383 IGF1RP08069 1367 aa29.56■■■□□ 2.32
UBE2I-216ENST00000567383 NUP160Q12769 1436 aa29.52■■■□□ 2.32
UBE2I-216ENST00000567383 CEP170Q5SW79 1584 aa29.52■■■□□ 2.32
UBE2I-216ENST00000567383 TRIM41Q8WV44 630 aa29.48■■■□□ 2.31
UBE2I-216ENST00000567383 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.42■■■□□ 2.3
UBE2I-216ENST00000567383 CUL7Q14999 1698 aa29.42■■■□□ 2.3
UBE2I-216ENST00000567383 ARAP1Q96P48 1450 aa29.4■■■□□ 2.3
UBE2I-216ENST00000567383 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.35■■■□□ 2.29
UBE2I-216ENST00000567383 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.34■■■□□ 2.29
UBE2I-216ENST00000567383 SHROOM2Q13796 1616 aa29.31■■■□□ 2.28
UBE2I-216ENST00000567383 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms