Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX31Q8N9S9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX31Q8N9S9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX31Q8N9S9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX31Q8N9S9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX31Q8N9S9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms