Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF148Q8N7C7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF148Q8N7C7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF148Q8N7C7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF148Q8N7C7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF148Q8N7C7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
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