Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC17Q8N6Y2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC17Q8N6Y2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC17Q8N6Y2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC17Q8N6Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms