Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF550Q7Z398 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF550Q7Z398 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF550Q7Z398 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF550Q7Z398 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms