Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 HDAC6-230ENST00000488543 2484 ntTSL 211.88□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)11.41□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-12■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-211ENST00000498534 481 ntTSL 210.91□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-208ENST00000465721 556 ntTSL 410.57□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 210.55□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GATD1-202ENST00000354286 3973 ntTSL 510.53□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 RABGAP1L-222ENST00000635248 3074 ntTSL 510.36□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GOLGA8B-210ENST00000569100 6488 ntTSL 59.94□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-204ENST00000538791 1081 ntTSL 29.88□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-212ENST00000541284 3563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZNF780B-201ENST00000221355 3538 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 49.12□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -17e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 58.6□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 USP34-216ENST00000487547 612 ntTSL 38.38□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PSMB3-210ENST00000618159 562 ntTSL 28.06□□□□□ -1.122e-10■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZNF780B-206ENST00000598845 401 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 38.03□□□□□ -1.127e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-210ENST00000491203 538 ntTSL 47.99□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)7.98□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.157e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.227e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.277e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.287e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 NFX1-202ENST00000379521 3609 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 26.7□□□□□ -1.347e-8■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CAMKMT-206ENST00000428993 526 ntTSL 36.45□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-217ENST00000544507 641 ntTSL 36.25□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.437e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 CD58-205ENST00000526981 395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.447e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-203ENST00000538403 753 ntTSL 25.92□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-209ENST00000539788 626 ntTSL 35.85□□□□□ -1.475e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 USP34-207ENST00000463046 6307 ntTSL 25.79□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 NFX1-205ENST00000466359 391 ntTSL 35.58□□□□□ -1.527e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 55.28□□□□□ -1.567e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.28□□□□□ -1.567e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 MAGI1-211ENST00000479287 556 ntTSL 55.21□□□□□ -1.587e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.627e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 44.94□□□□□ -1.627e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZNF780B-205ENST00000595995 393 ntTSL 54.94□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.627e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 REXO2-219ENST00000546316 726 ntTSL 34.88□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)4.71□□□□□ -1.657e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.697e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-215ENST00000640465 4365 ntTSL 1 (best)4.06□□□□□ -1.767e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 PSMB3-209ENST00000614132 426 ntTSL 23.87□□□□□ -1.792e-9■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.797e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 USP34-202ENST00000411912 4309 ntTSL 53.58□□□□□ -1.847e-7■■■■■ 35.5
LARP4Q71RC2 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 36.48□□□□□ -1.371e-12■■■■■ 35.4
LARP4Q71RC2 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 24.87□□□□□ -1.636e-8■■■■■ 35.4
LARP4Q71RC2 ATP5G1-203ENST00000502964 679 ntTSL 29.58□□□□□ -0.885e-9■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ELP4-206ENST00000638317 450 ntTSL 315.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ELP4-217ENST00000639182 857 ntTSL 513□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ELP4-213ENST00000638828 4647 ntTSL 22.92□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.461e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.811e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 RPS26-203ENST00000552361 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.389e-13■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 COX7B-201ENST00000373335 497 ntTSL 24.18□□□□□ -1.749e-13■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.079e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 37.91□□□□□ -1.149e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.439e-7■■■■■ 35.2
LARP4Q71RC2 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 35.1
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 359.9 ms