RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545588.5

ZBED6-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 7,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZBED6-201ENST00000545588 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.49□□□□□ -1.05
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ZBED6-201ENST00000545588 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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ZBED6-201ENST00000545588 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.14□□□□□ -1.11
ZBED6-201ENST00000545588 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8□□□□□ -1.13
ZBED6-201ENST00000545588 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.88□□□□□ -1.15
ZBED6-201ENST00000545588 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
ZBED6-201ENST00000545588 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
ZBED6-201ENST00000545588 MYT1Q01538 1121 aa7.82□□□□□ -1.16
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ZBED6-201ENST00000545588 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
ZBED6-201ENST00000545588 TRIM41Q8WV44 630 aa7.78□□□□□ -1.16
ZBED6-201ENST00000545588 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.76□□□□□ -1.17
ZBED6-201ENST00000545588 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
ZBED6-201ENST00000545588 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
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ZBED6-201ENST00000545588 NEFLP07196 543 aa7.7□□□□□ -1.18
ZBED6-201ENST00000545588 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.58□□□□□ -1.2
ZBED6-201ENST00000545588 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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ZBED6-201ENST00000545588 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ZBED6-201ENST00000545588 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.43□□□□□ -1.22
ZBED6-201ENST00000545588 ITGAEP38570 1179 aa7.42□□□□□ -1.22
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ZBED6-201ENST00000545588 CHIC1Q5VXU3 224 aa7.37□□□□□ -1.23
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ZBED6-201ENST00000545588 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.33□□□□□ -1.24
ZBED6-201ENST00000545588 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ZBED6-201ENST00000545588 ABCC9O60706 1549 aa7.31□□□□□ -1.24
ZBED6-201ENST00000545588 HRCP23327 699 aa7.3□□□□□ -1.24
ZBED6-201ENST00000545588 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.29□□□□□ -1.24
ZBED6-201ENST00000545588 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ZBED6-201ENST00000545588 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ZBED6-201ENST00000545588 TRIM52Q96A61 297 aa7.26□□□□□ -1.25
ZBED6-201ENST00000545588 NEFMP07197 916 aa7.24□□□□□ -1.25
ZBED6-201ENST00000545588 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.24□□□□□ -1.25
ZBED6-201ENST00000545588 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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ZBED6-201ENST00000545588 ANP32CO43423 234 aa7.2□□□□□ -1.26
ZBED6-201ENST00000545588 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.261e-7■■□□□ 12.5
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ZBED6-201ENST00000545588 SLC24A1O60721 1099 aa7.18□□□□□ -1.26
ZBED6-201ENST00000545588 NEUROD1Q13562 356 aa7.17□□□□□ -1.26
ZBED6-201ENST00000545588 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ZBED6-201ENST00000545588 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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ZBED6-201ENST00000545588 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ZBED6-201ENST00000545588 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ZBED6-201ENST00000545588 TONSLQ96HA7 1378 aa7.03□□□□□ -1.28
ZBED6-201ENST00000545588 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.03□□□□□ -1.28
ZBED6-201ENST00000545588 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.03□□□□□ -1.28
ZBED6-201ENST00000545588 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.02□□□□□ -1.28
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ZBED6-201ENST00000545588 BCL11AQ9H165 835 aa7.02□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 P3H3Q8IVL6 736 aa7.02□□□□□ -1.29
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ZBED6-201ENST00000545588 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 ARID3CA6NKF2 412 aa6.98□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.97□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 NACADO15069 1562 aa6.97□□□□□ -1.29
ZBED6-201ENST00000545588 TSPY4P0CV99 314 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 TSPY10P0CW01 314 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 TMC1Q8TDI8 760 aa6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.93□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.92□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 PLPPR3Q6T4P5 718 aa6.92□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 9.8
ZBED6-201ENST00000545588 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 EEA1Q15075 1411 aa6.88□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 CDCA8Q53HL2 280 aa6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 ERCC6Q03468 1493 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 C14orf37Q86TY3 774 aa6.85□□□□□ -1.31
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