RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545588.5

ZBED6-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 7,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZBED6-201ENST00000545588 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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ZBED6-201ENST00000545588 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
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ZBED6-201ENST00000545588 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.33□□□□□ -1.24
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ZBED6-201ENST00000545588 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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ZBED6-201ENST00000545588 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.24□□□□□ -1.25
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ZBED6-201ENST00000545588 NEUROD1Q13562 356 aa7.17□□□□□ -1.26
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ZBED6-201ENST00000545588 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.02□□□□□ -1.28
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ZBED6-201ENST00000545588 TSPY4P0CV99 314 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 TSPY10P0CW01 314 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 TMC1Q8TDI8 760 aa6.94□□□□□ -1.3
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ZBED6-201ENST00000545588 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
ZBED6-201ENST00000545588 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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ZBED6-201ENST00000545588 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.92□□□□□ -1.3
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ZBED6-201ENST00000545588 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 EEA1Q15075 1411 aa6.88□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 CDCA8Q53HL2 280 aa6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 ERCC6Q03468 1493 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED6-201ENST00000545588 C14orf37Q86TY3 774 aa6.85□□□□□ -1.31
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