RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
USP34-216ENST00000487547 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.48■■■□□ 2.79
USP34-216ENST00000487547 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
USP34-216ENST00000487547 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
USP34-216ENST00000487547 FOXD1Q16676 465 aa26.73■■□□□ 1.87
USP34-216ENST00000487547 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.11■■□□□ 1.77
USP34-216ENST00000487547 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.31■■□□□ 1.64
USP34-216ENST00000487547 ADRA2BP18089 450 aa25.23■■□□□ 1.63
USP34-216ENST00000487547 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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USP34-216ENST00000487547 POTEDQ86YR6 584 aa23.56■■□□□ 1.36
USP34-216ENST00000487547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
USP34-216ENST00000487547 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP34-216ENST00000487547 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.94■■□□□ 1.26
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USP34-216ENST00000487547 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP34-216ENST00000487547 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.42■■□□□ 1.18
USP34-216ENST00000487547 KCNA4P22459 653 aa22.35■■□□□ 1.17
USP34-216ENST00000487547 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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USP34-216ENST00000487547 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP34-216ENST00000487547 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.81■■□□□ 1.08
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USP34-216ENST00000487547 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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USP34-216ENST00000487547 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
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USP34-216ENST00000487547 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
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USP34-216ENST00000487547 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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USP34-216ENST00000487547 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
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USP34-216ENST00000487547 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.5■□□□□ 0.55
USP34-216ENST00000487547 PITPNM1O00562 1244 aa18.38■□□□□ 0.53
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USP34-216ENST00000487547 PROM2Q8N271 834 aa18.22■□□□□ 0.51
USP34-216ENST00000487547 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.17■□□□□ 0.5
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USP34-216ENST00000487547 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
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USP34-216ENST00000487547 EVX2Q03828 476 aa17.54■□□□□ 0.4
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USP34-216ENST00000487547 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
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USP34-216ENST00000487547 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
USP34-216ENST00000487547 SPOCK2Q92563 424 aa17.27■□□□□ 0.36
USP34-216ENST00000487547 GABBR2O75899 941 aa17.16■□□□□ 0.34
USP34-216ENST00000487547 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.15■□□□□ 0.34
USP34-216ENST00000487547 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
USP34-216ENST00000487547 NUBP1P53384 320 aa17.1■□□□□ 0.33
USP34-216ENST00000487547 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
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USP34-216ENST00000487547 FAM212AQ96EL1 285 aa17.05■□□□□ 0.32
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