Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC55Q6ZSA7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC55Q6ZSA7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC55Q6ZSA7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC55Q6ZSA7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC55Q6ZSA7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC55Q6ZSA7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC55Q6ZSA7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms