Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRIP3Q6Q6R5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRIP3Q6Q6R5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRIP3Q6Q6R5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms