Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC12Q6PEW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC12Q6PEW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZCCHC12Q6PEW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC12Q6PEW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC12Q6PEW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms