Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGM2L1Q6PCE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM2L1Q6PCE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGM2L1Q6PCE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGM2L1Q6PCE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGM2L1Q6PCE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms