Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
APOBEC3HQ6NTF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
APOBEC3HQ6NTF7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APOBEC3HQ6NTF7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
APOBEC3HQ6NTF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
APOBEC3HQ6NTF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBEC3HQ6NTF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBEC3HQ6NTF7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBEC3HQ6NTF7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
APOBEC3HQ6NTF7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31■■■□□ 2.55
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
APOBEC3HQ6NTF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms