Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPI1

CTRB2, Chymotrypsinogen B2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB2Q6GPI1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRB2Q6GPI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRB2Q6GPI1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRB2Q6GPI1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTRB2Q6GPI1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTRB2Q6GPI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms