Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SUSD4Q5VX71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SUSD4Q5VX71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SUSD4Q5VX71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SUSD4Q5VX71 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SUSD4Q5VX71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SUSD4Q5VX71 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SUSD4Q5VX71 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SUSD4Q5VX71 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SUSD4Q5VX71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SUSD4Q5VX71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SUSD4Q5VX71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms