Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCN1P1Q5VSP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN1P1Q5VSP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN1P1Q5VSP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LCN1P1Q5VSP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms