Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF3Q5TH69 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF3Q5TH69 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF3Q5TH69 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARFGEF3Q5TH69 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF3Q5TH69 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF3Q5TH69 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF3Q5TH69 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF3Q5TH69 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF3Q5TH69 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms