Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDSS1Q5T2R2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS1Q5T2R2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDSS1Q5T2R2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDSS1Q5T2R2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms