Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C10orf55Q5SWW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C10orf55Q5SWW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C10orf55Q5SWW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms