Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAT3Q53EU6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPAT3Q53EU6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPAT3Q53EU6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAT3Q53EU6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 645.2 ms