Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SVEP1Q4LDE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVEP1Q4LDE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVEP1Q4LDE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms