Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUSP28Q4G0W2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DUSP28Q4G0W2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DUSP28Q4G0W2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUSP28Q4G0W2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DUSP28Q4G0W2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUSP28Q4G0W2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms