Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP20-2Q3LI61 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms