Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9K0

TMEM44, Transmembrane protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM44Q2T9K0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM44Q2T9K0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM44Q2T9K0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM44Q2T9K0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM44Q2T9K0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms