Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GEN1Q17RS7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GEN1Q17RS7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GEN1Q17RS7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GEN1Q17RS7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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