Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA6Q16445 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA6Q16445 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA6Q16445 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA6Q16445 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA6Q16445 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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