Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD5Q16401 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD5Q16401 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD5Q16401 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD5Q16401 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD5Q16401 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD5Q16401 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD5Q16401 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD5Q16401 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD5Q16401 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD5Q16401 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD5Q16401 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD5Q16401 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD5Q16401 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD5Q16401 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD5Q16401 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD5Q16401 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD5Q16401 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMD5Q16401 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMD5Q16401 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PSMD5Q16401 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms