Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRD3Q15059 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD3Q15059 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD3Q15059 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD3Q15059 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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