Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RRS1Q15050 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
RRS1Q15050 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRS1Q15050 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRS1Q15050 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRS1Q15050 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRS1Q15050 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRS1Q15050 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRS1Q15050 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
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