Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KARSQ15046 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KARSQ15046 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KARSQ15046 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KARSQ15046 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KARSQ15046 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KARSQ15046 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KARSQ15046 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KARSQ15046 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KARSQ15046 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KARSQ15046 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KARSQ15046 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KARSQ15046 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KARSQ15046 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KARSQ15046 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KARSQ15046 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KARSQ15046 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KARSQ15046 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KARSQ15046 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KARSQ15046 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KARSQ15046 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KARSQ15046 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KARSQ15046 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KARSQ15046 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KARSQ15046 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KARSQ15046 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KARSQ15046 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KARSQ15046 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KARSQ15046 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KARSQ15046 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KARSQ15046 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KARSQ15046 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KARSQ15046 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KARSQ15046 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KARSQ15046 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KARSQ15046 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KARSQ15046 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KARSQ15046 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KARSQ15046 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KARSQ15046 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KARSQ15046 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KARSQ15046 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KARSQ15046 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KARSQ15046 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KARSQ15046 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KARSQ15046 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KARSQ15046 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KARSQ15046 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KARSQ15046 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KARSQ15046 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KARSQ15046 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KARSQ15046 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KARSQ15046 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KARSQ15046 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KARSQ15046 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KARSQ15046 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KARSQ15046 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KARSQ15046 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KARSQ15046 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KARSQ15046 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KARSQ15046 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KARSQ15046 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KARSQ15046 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KARSQ15046 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KARSQ15046 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KARSQ15046 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KARSQ15046 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KARSQ15046 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KARSQ15046 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KARSQ15046 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KARSQ15046 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KARSQ15046 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KARSQ15046 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KARSQ15046 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KARSQ15046 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KARSQ15046 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KARSQ15046 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KARSQ15046 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KARSQ15046 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KARSQ15046 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KARSQ15046 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KARSQ15046 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KARSQ15046 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KARSQ15046 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KARSQ15046 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KARSQ15046 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KARSQ15046 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KARSQ15046 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KARSQ15046 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KARSQ15046 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KARSQ15046 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KARSQ15046 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KARSQ15046 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KARSQ15046 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KARSQ15046 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KARSQ15046 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KARSQ15046 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KARSQ15046 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KARSQ15046 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KARSQ15046 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
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