Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAM2Q15035 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAM2Q15035 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAM2Q15035 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAM2Q15035 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM2Q15035 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms