Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 516.59■□□□□ 0.257e-11■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-323■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 RPL13A-207ENST00000476300 619 ntTSL 311.22□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 39.4
NOLC1Q14978 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.649e-35■■■■■ 39.4
NOLC1Q14978 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.729e-35■■■■■ 39.4
NOLC1Q14978 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.869e-35■■■■■ 39.4
NOLC1Q14978 MATR3-235ENST00000506147 580 ntTSL 417.31■□□□□ 0.361e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-239ENST00000514694 587 ntTSL 416.88■□□□□ 0.291e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-238ENST00000512107 579 ntTSL 415.91■□□□□ 0.141e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-203ENST00000506188 801 ntTSL 415.34■□□□□ 0.051e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-201ENST00000448190 542 ntTSL 414.62□□□□□ -0.071e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-236ENST00000509644 750 ntTSL 314.1□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-208ENST00000514110 679 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 213.35□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-202ENST00000505522 629 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-206ENST00000508735 310 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 413.24□□□□□ -0.291e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-207ENST00000513259 444 ntTSL 59.63□□□□□ -0.871e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.391e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG4-205ENST00000507692 575 ntTSL 55.51□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 39.1
NOLC1Q14978 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 54.84□□□□□ -1.631e-323■■■■■ 39
NOLC1Q14978 ATP5A1-213ENST00000590406 756 ntTSL 321.33■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 38.8
NOLC1Q14978 ATP5A1-212ENST00000590324 807 ntTSL 510.74□□□□□ -0.699e-8■■■■■ 38.8
NOLC1Q14978 ATP5A1-209ENST00000589611 995 ntTSL 210.48□□□□□ -0.739e-8■■■■■ 38.8
NOLC1Q14978 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.651e-323■■■■■ 38.8
NOLC1Q14978 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 225.87■■□□□ 1.733e-78■■■■■ 38.6
NOLC1Q14978 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-78■■■■■ 38.6
NOLC1Q14978 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 219.02■□□□□ 0.643e-78■■■■■ 38.6
NOLC1Q14978 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 317.46■□□□□ 0.393e-78■■■■■ 38.6
NOLC1Q14978 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.433e-78■■■■■ 38.6
NOLC1Q14978 LDHB-206ENST00000470985 678 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.269e-8■■■■■ 38.4
NOLC1Q14978 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 38.2
NOLC1Q14978 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 217.16■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 37.9
NOLC1Q14978 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 37.9
NOLC1Q14978 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.717e-9■■■■■ 37.8
NOLC1Q14978 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.937e-9■■■■■ 37.8
NOLC1Q14978 PPAN-206ENST00000466025 523 ntTSL 219.78■□□□□ 0.762e-20■■■■■ 37.7
NOLC1Q14978 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.97□□□□□ -1.772e-20■■■■■ 37.7
NOLC1Q14978 TNPO2-212ENST00000588491 737 ntTSL 517.5■□□□□ 0.391e-323■■■■■ 37.7
NOLC1Q14978 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.121e-323■■■■■ 37.7
NOLC1Q14978 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 231.01■■■□□ 2.554e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)27.57■■■□□ 24e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)26.3■■□□□ 1.84e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.394e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)23.75■■□□□ 1.394e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 ZFAS1-209ENST00000620594 508 ntTSL 38.4□□□□□ -1.064e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 27.83□□□□□ -1.164e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.164e-10■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.59□□□□□ -1.351e-323■■■■■ 37.5
NOLC1Q14978 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 RBX1-202ENST00000467617 1871 ntTSL 214.99□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 SNHG14-208ENST00000453082 6087 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 RELN-206ENST00000473945 688 ntTSL 39.71□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.768e-7■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3□□□□□ -1.938e-7■■■■■ 37.4
NOLC1Q14978 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.135e-11■■■■■ 37.1
NOLC1Q14978 CPNE3-208ENST00000614678 4201 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.415e-11■■■■■ 37.1
NOLC1Q14978 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 37
NOLC1Q14978 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.353e-11■■■■■ 36.9
NOLC1Q14978 UQCRC1-202ENST00000412343 778 ntTSL 323.59■■□□□ 1.378e-7■■■■■ 36.9
NOLC1Q14978 UQCRC1-206ENST00000467690 931 ntTSL 221.85■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 36.9
NOLC1Q14978 UQCRC1-205ENST00000463708 739 ntTSL 314.41□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 36.9
NOLC1Q14978 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 36.8
NOLC1Q14978 WDR43-201ENST00000296126 787 ntTSL 55.49□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 36.7
NOLC1Q14978 WDR43-204ENST00000440983 541 ntTSL 45.49□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 36.7
NOLC1Q14978 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.191e-323■■■■■ 36.7
NOLC1Q14978 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.961e-323■■■■■ 36.7
NOLC1Q14978 XRCC5-209ENST00000485763 616 ntTSL 27.59□□□□□ -1.192e-8■■■■■ 36.7
NOLC1Q14978 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)6.84□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 36.7
NOLC1Q14978 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.2■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 36.1
NOLC1Q14978 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 36.1
NOLC1Q14978 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 36.1
NOLC1Q14978 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 36.1
NOLC1Q14978 RPS27A-204ENST00000449323 422 ntTSL 35.29□□□□□ -1.569e-18■■■■■ 35.9
NOLC1Q14978 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.234e-7■■■■■ 35.6
NOLC1Q14978 ACAP3-209ENST00000476572 819 ntTSL 517.34■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 35.6
NOLC1Q14978 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.754e-7■■■■■ 35.6
NOLC1Q14978 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -14e-7■■■■■ 35.6
NOLC1Q14978 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 35.6
NOLC1Q14978 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 35.6
NOLC1Q14978 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 35.6
NOLC1Q14978 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.197e-10■■■■■ 35.4
NOLC1Q14978 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.127e-10■■■■■ 35.4
NOLC1Q14978 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.037e-10■■■■■ 35.4
NOLC1Q14978 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 414.47□□□□□ -0.097e-10■■■■■ 35.4
NOLC1Q14978 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.977e-10■■■■■ 35.4
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