RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413221.6

EPB41L4A-AS1-201, EPB41L4A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EPB41L4A-AS1, Length 2,969 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.57■■■□□ 2.32
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 HRCP23327 699 aa26.83■■□□□ 1.89
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.48■■□□□ 1.83
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.43■■□□□ 1.82
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.88■■□□□ 1.73
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.47■■□□□ 1.67
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.4■■□□□ 1.66
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.31■■□□□ 1.64
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.12■■□□□ 1.61
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 MYT1Q01538 1121 aa24.94■■□□□ 1.58
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 NEUROD1Q13562 356 aa24.81■■□□□ 1.56
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.73■■□□□ 1.55
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.63■■□□□ 1.53
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 TRIM41Q8WV44 630 aa24.36■■□□□ 1.49
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ABCC9O60706 1549 aa24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SCRIBQ14160 1630 aa23.91■■□□□ 1.42
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 MIER1Q8N108 512 aa23.78■■□□□ 1.4
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.58■■□□□ 1.37
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 BCL11AQ9H165 835 aa23.52■■□□□ 1.36
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.45■■□□□ 1.34
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 NACADO15069 1562 aa23.4■■□□□ 1.34
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.35■■□□□ 1.33
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.35■■□□□ 1.33
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CEP162Q5TB80 1403 aa23.2■■□□□ 1.3
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.16■■□□□ 1.3
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 BCANQ96GW7 911 aa23.14■■□□□ 1.3
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.13■■□□□ 1.29
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 WIZO95785 1651 aa23.01■■□□□ 1.27
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.98■■□□□ 1.27
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.97■■□□□ 1.27
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.92■■□□□ 1.26
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SOGA1O94964 1423 aa22.92■■□□□ 1.26
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 FKBP8Q14318 412 aa22.9■■□□□ 1.26
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 KCNH8Q96L42 1107 aa22.88■■□□□ 1.25
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ABCC8Q09428 1581 aa22.86■■□□□ 1.25
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 APLP2Q06481 763 aa22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.76■■□□□ 1.23
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ITGAEP38570 1179 aa22.76■■□□□ 1.23
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.71■■□□□ 1.23
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 NEFLP07196 543 aa22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 GOLGA3Q08378 1498 aa22.64■■□□□ 1.21
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SMARCA4P51532 1647 aa22.62■■□□□ 1.21
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 MSH5O43196 834 aa22.6■■□□□ 1.21
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.59■■□□□ 1.21
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CLIP1P30622 1438 aa22.57■■□□□ 1.2
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 EEA1Q15075 1411 aa22.56■■□□□ 1.2
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 TRIM52Q96A61 297 aa22.54■■□□□ 1.2
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.48■■□□□ 1.19
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.37■■□□□ 1.17
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SMARCA2P51531 1590 aa22.37■■□□□ 1.17
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.29■■□□□ 1.16
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ANP32CO43423 234 aa22.25■■□□□ 1.15
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.22■■□□□ 1.15
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 KIF21BO75037 1637 aa22.21■■□□□ 1.15
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.2■■□□□ 1.14
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.2■■□□□ 1.14
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 NBR1Q14596 966 aa22.17■■□□□ 1.14
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 CCER2I3L3R5 266 aa22.13■■□□□ 1.13
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms