Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCAPQ14761 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRCAPQ14761 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRCAPQ14761 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCAPQ14761 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCAPQ14761 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAPQ14761 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCAPQ14761 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCAPQ14761 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCAPQ14761 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCAPQ14761 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCAPQ14761 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCAPQ14761 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCAPQ14761 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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