Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPARCL1Q14515 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPARCL1Q14515 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPARCL1Q14515 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPARCL1Q14515 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPARCL1Q14515 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPARCL1Q14515 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPARCL1Q14515 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPARCL1Q14515 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPARCL1Q14515 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPARCL1Q14515 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPARCL1Q14515 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPARCL1Q14515 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms