Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARB2Q14108 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARB2Q14108 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARB2Q14108 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARB2Q14108 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARB2Q14108 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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