Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE6HQ13956 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE6HQ13956 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE6HQ13956 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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