Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL3Q13618 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL3Q13618 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CUL3Q13618 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL3Q13618 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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