Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMED1Q13445 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED1Q13445 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMED1Q13445 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMED1Q13445 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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