Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLF1Q13351 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KLF1Q13351 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLF1Q13351 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLF1Q13351 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLF1Q13351 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLF1Q13351 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLF1Q13351 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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