Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CGNL1Q0VF96 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CGNL1Q0VF96 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CGNL1Q0VF96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CGNL1Q0VF96 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CGNL1Q0VF96 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CGNL1Q0VF96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms