Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCRN3Q0VDG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCRN3Q0VDG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCRN3Q0VDG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms