Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4DQ08499 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDE4DQ08499 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE4DQ08499 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4DQ08499 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4DQ08499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4DQ08499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms