Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF4Q08170 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF4Q08170 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF4Q08170 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF4Q08170 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms