Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
ERCC6Q03468 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
ERCC6Q03468 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC46.11■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
ERCC6Q03468 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.96
ERCC6Q03468 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ERCC6Q03468 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
ERCC6Q03468 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ERCC6Q03468 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
ERCC6Q03468 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
ERCC6Q03468 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC45.94■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
ERCC6Q03468 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ERCC6Q03468 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
ERCC6Q03468 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
ERCC6Q03468 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ERCC6Q03468 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.88■■■■■ 4.94
ERCC6Q03468 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
ERCC6Q03468 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
ERCC6Q03468 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
ERCC6Q03468 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms