Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARDQ03181 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPARDQ03181 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARDQ03181 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARDQ03181 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARDQ03181 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms