Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBXN2AP68543 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBXN2AP68543 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBXN2AP68543 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBXN2AP68543 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBXN2AP68543 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBXN2AP68543 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms